En el año de 1938 fue expedido el Decreto No. 848 de mayo 12 y los decretos legislativos números 1965 y 1976, mediante los cuales se creó y reglamentó el servicio arqueológico adscrito a la sección de extensión cultural y bellas artes del Ministerio de Educación Nacional. En este mismo año 1938, el servicio arqueológico inició labores con un personal de tres empleados, un jefe, un dibujante y una secretaria y dos celadores para para lugares arqueológicos San Agustín y Tierradentro. Su primera labor fue la organización y presentación de lo que entonces se llamó exposición arqueológica la que continuó como museo. El museo de arqueología así constituido bajo la dirección del profesor Gregorio Hernández de Alba, fue instalado en algunas de las salas del edificio de la Biblioteca Nacional en Bogotá. Las colecciones que lo formaban eran de carácter arqueológico en su mayor parte. Además pequeñas colecciones etnográficas y antropológicas, en su totalidad procedentes del territorio colombiano y que habían pertenecido unas al antiguo Museo Nacional de Bogotá.