La tesis que defiende este trabajo es que Bernardo de Vargas Machuca, caudillo colonial de finales de siglo XVI y principios del XVII, en su obra Milicia y descripción de las Indias además de ser consciente de su propia autonomía y de la legitimidad de sus acciones, pudo realizar toda una taxonomía de dicha autonomía, en términos de las facultades que convierten al caudillo, en líder militar y en gobernador, como una especie de príncipe sin corona, puesto que su libro, aparte de servir como probanza de méritos y servicios, e inscribirse a su modo en este género de escritura, fue toda una labor por convertir la vida militar de las Indias en ciencia y poner al caudillo como la quintaesencia de la misma. En ese sentido el libro responde al objetivo principal de indagar sobre la identidad del caudillo y su liderazgo en el marco de la dimensión política del mundo colonial, a través del análisis del título y examinar la situación de autonomía de los caudillos de finales del siglo XVI y principios del XVII, así como la complejidad de sus relaciones - en particular con la Corona y, en general, con toda la sociedad de la época - a partir de la obra concreta el aporte que se pretendió realizar a los estudios en historia colonial.