La obra estudia la figura del catedrático y rector de la Universidad de Sevilla en la primera década del siglo XVII hasta que fue nombrado oidor de la Audiencia de Santa Fe de Bogotá en 1608, donde desarrolló una importante labor defendiendo los derechos de los más débiles, los indios, como puso de manifiesto sobre todo en las visitas a las provincias de Cartagena de Indias y Pamplona (actuales Santanderes), a pesar de la oposición del gobernador, del obispo y de los vecinos. Fue un incondicional colaborador del gobernador Juan de Borja -veintitrés años en el cargo- en dejar actas de la guerra contra los pijaos y otros indios, en visitar las minas de plata de Mariquita y las de esmeraldas de Muzo, en visitar los indios de boga del río Magdalena, en organizar obras públicas, en conducir tandas de mitayos a las minas y en abastecer a la ciudad capital de suministros en años de escasez y hasta de colectar un donativo gracioso. Su promoción a la Audiencia de México sólo le produjo disgustos a causa de su enfrentamiento con el virrey, Don Rodrigo Pacheco Osorio, marqués de Cerralbo por asuntos de justicia y de corrupción. Su ruptura definitiva la provocó la gestión de Villabona como superintendente del desagüe de Huehuetoca con el fin de aliviar a la ciudad de la tremenda inundación registrada en septiembre de 1629. La ruptura fue tal que Villabona acabó pasando al estamento clerical ordenado sacerdote, expulsado de la Audiencia.